TransportMaps 2.0b3

支持的系统

• *像nix一样的操作系统（linux、unix，…）
• Mac操作系统

其他操作系统尚未经过测试，可能需要更复杂的安装过程（包括Microsoft Windows系列…）。

我们建议使用virtualenv或Anaconda在虚拟环境中工作。

安装要求

gcc（或另一个C/C++编译器）
• gfortran（或其他Fortran编译器）

自动安装

首先确保安装了最新版本的pip

$ pip install –upgrade pip

可以运行以下命令安装包及其python依赖项：

$ pip install –upgrade numpy $ pip install –upgrade TransportMaps

如果需要启用某些可选依赖项：

$ MPI=True SPHINX=True PLOT=True H5PY=True pip install –upgrade TransportMaps

这些选项将安装以下模块：

• MPI—并行化例程（请参见tutorial）。它需要单独安装mpi后端（openMPI，mpich等）。将安装以下python模块： *mpi4py *mpi_map
• 绘图-绘图功能：
  • MatPlotLib
• Sphinx–文档生成例程：
  • sphinx
  • sphinxcontrib-bibtex
  • ipython
  • nbsphinx
• h5py–存储大数据集的例程。它需要单独安装hdf5后端。
  • mpi4py
  • h5py
• pyhmc—哈密顿马尔可夫链蒙特卡罗程序
  • pyhmc

手动安装

如果自动安装出现任何问题，您可以尝试手动安装以下软件包。

必需的后端包（通常与numpy一起安装）：

• BLAS（带有开发/头文件）
• LAPACK（带有开发/头文件）

必需的python包：

• pip
• numpy>；=1.10
• scipy
• orthpol_light
• SpectralToolbox
• dill

最后安装transportmaps:

$ pip install TransportMaps

运行单元测试

单元测试可用，可以通过以下命令运行：

>>> import TransportMaps as TM
>>> TM.tests.run_all()

有3500个单元测试，运行所有测试都需要一些时间。

状态

	Binary (PyPi)	Public source (Bitbucket)	Private master (Bitbucket)	Private develop (Bitbucket)	Private hotfixes (Bitbucket)
Serial
MPI

学分

这个软件是由麻省理工学院的{a29}在youssef marzouk教授的指导下开发和维护的。

开发团队