层析工作流程库
tomwer的Python项目详细描述
此项目包含为esrf使用而制作的小部件，以便使用orange3画布和core（http://orange.biolab.si）定义工作流。
安装
步骤0-创建虚拟环境
建议创建一个python虚拟环境来运行工作流工具。 虚拟环境可以避免python包之间的冲突。但您也可以将其安装到“当前”python环境中，并转到步骤1。
virtualenv --python=python3 --system-site-packages myvirtualenv
然后激活虚拟环境
source myvirtualenv/bin/activate
首先更新pip和setuptools以避免一些潜在的错误
pip install --upgrade pip pip install setuptools --upgrade
注意
退出虚拟环境
deactivate
步骤1-Orange3安装
为了运行tomwer项目，您需要一个原始orange项目的分叉。 这是必需的，因为为了得到我们想要的行为（有循环工作流），已经做了一些小的修改。
在这里可以使用叉子：https://github.com/payno/orange3.git
所以请安装这个叉子：
git clone https://github.com/payno/orange3.git
cd orange3
pip install -r requirements.txt
pip install -r requirements-gui.txt
pip install .
注意
如果您有一个旧的pyqt版本，您可能需要查看https://pythonhosted.org/silx/virtualenv.html?highlight=virtualenv以避免重建sip…您可能需要创建一个符号链接：
如果要使用安装在/usr/lib/python2.7/dist-packages/中的pyqt4：
ln -s /usr/lib/python2.7/dist-packages/PyQt4 silx_venv/lib/python2.7/site-packages/ ln -s /usr/lib/python2.7/dist-packages/sip.so silx_venv/lib/python2.7/site-packages/
步骤2-t功率
克隆tomwer项目
git clone git@gitlab.esrf.fr:payno/tomwer.git
然后安装它
cd tomwer
pip install -r requirements.txt
pip install -e .
注意
-e option会将插件注册到orange中，但不应该将其复制到python的site packages目录中。这是因为橙色附加组件的安装过程。这也意味着对源代码的任何修改都将在执行期间应用。
确保安装顺利，橙色运行正常。
python run_tests.py
单元测试应该在没有任何错误的情况下执行。
步骤3-网络日志
工作流工具可以将一些日志发送到graylog中，以便查看工作流执行的状态。 如果这是活动的（默认情况下），那么您将能够从web界面看到重要的日志。
要获取更多信息，请参见https://www.graylog.org/
启动橙色
您只需执行以下命令：
orange-canvas
注意
如果您安装了虚拟环境，请不要忘记激活它：
source myvirtualenv/bin/activate
文档
cd doc
make html
文档是在doc/build/html中构建的，入口点是index.html
firefox build/html/index.html
注意
文档的构建需要安装sphinx。这不是一种严格的依赖。所以你可能需要安装它。
您还应该生成可从橙色gui访问的文档（按f1键）。
cd doc
make htmlhelp
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