使用幸存者操作结构变体的vcf文件
surpyvor的Python项目详细描述
超过
围绕SURVIVOR的python包装器，具有附加的便利功能。
安装和依赖项
superyvor要求在$path中安装bcftools、bgzip、tabix和survivor。
子命令：
merge merging vcf files of SVs
highsens get union of SV vcfs
highconf get intersection of SV vcfs
prf calculate precision, recall and F-measure
upset Make upset plot for multiple SV vcf files
每个子命令都有自己的帮助信息，可以通过运行surpyvor <command> -h/--help
引文
如果您使用这个工具，请考虑引用我们的publication和citation for SURVIVOR。
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