具有最低共同祖先检索的任意iterable的广义后缀树

suffix-tree的Python项目详细描述


任何python iterable的通用后缀树,具有最低的公共祖先 检索。

pip install suffix-tree

此后缀树:

  • 适用于任何python iterable,而不仅仅是字符串,如果项是散列的,
  • 是iterable集的广义后缀树,
  • 使用Ukkonen的算法在线性时间内构建树,
  • 做恒定时间最低的共同祖先检索,
  • 将树输出为graphviz.dot文件。

已经实现了三种不同的构建器:

  • 一个遵循Ukkonen原始论文([Ukkonen1995])的人,
  • 一个遵循gusfield的变体([Gusfield1997]),
  • 还有一个简单的朴素算法。

PYPI:https://pypi.org/project/suffix-tree/

[Ukkonen1995]Ukkonen, Esko. On-line construction of suffix trees. 1995. Algorithmica 14:249-60. http://www.cs.helsinki.fi/u/ukkonen/SuffixT1withFigs.pdf
[Gusfield1997]Gusfield, Dan. Algorithms on strings, trees, and sequences. 1997. Cambridge University Press.

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