python模块,提供用于测量两个分段的多神经元峰值活动之间相似性的功能。

spykesim的Python项目详细描述


版权所有(c)2019 Keita Watanabe

兹免费准许任何人取得副本 本软件和相关文档文件(“软件”)的 在软件中不受限制,包括但不限于 使用、复制、修改、转到、发布、分发、再授权和/或出售 软件的副本,并允许软件的用户 在满足以下条件的情况下,可以这样做:

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说明:35;<;img src=“docs/spykesim logo/wtext/spykesim wtext.svg”width=“320px”>;

[![pypi](https://img.shields.io/pypi/v/spykesim.svg)](https://pypi.org/project/spykesim/) [![麻省理工学院许可证](http://img.shields.io/badge/license-MIT-blue.svg?style=flat)](LICENSE) [![生成状态](https://travis-ci.org/KeitaW/spykesim.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/KeitaW/spykesim

spykesim是一个python模块,它提供了测量两个分段的多神经峰值活动之间相似性的函数。

实现了扩展编辑相似度度量。你可以在下面的报纸上找到细节。

生物毒性:https://www.biorxiv.org/content/early/2017/10/30/202655

这个库是算法的重新实现。原始实现可以在[this repo](https://github.com/KeitaW/Chaldea)中找到。

35;支持的操作系统 这个库在ubuntu和macos上测试过。

对于windows用户:请考虑通过[windows subsystem for linux](https://docs.microsoft.com/en-us/windows/wsl/install-win10)使用ubuntu。

35;安装 如果您的环境中没有python3.6,则可以使用[anaconda](https://www.anaconda.com/distribution/)。

[cython](https://github.com/cython/cython)和[numpy](https://github.com/numpy/numpy)需要预先安装,因为它们将在安装过程中使用。

如果尚未安装这些软件包,请运行以下命令: {tt1}$ 也可以通过PIP安装此库: {tt2}$ 或者你可以自己克隆和构建: {tt3}$p>

\ 35;\35;依赖关系

  • Python(>;=3.6)
  • numpy(需要预先安装)
  • cython(需要预先安装)
  • scipy
  • 全面质量管理
  • h5py

-35;教程 您可以在[doc](https://github.com/KeitaW/spykesim/blob/master/docs/tutorial.ipynb)中找到教程。

35;引文 您可以使用以下bib条目引用此作品: {tt4}$p>

-35;

此项目使用以下存储库作为模板。

{a11} 原始许可文件可以在[此处](misc/original license.md)中找到。

平台:未知

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

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