python模块,提供用于测量两个分段的多神经元峰值活动之间相似性的功能。
spykesim的Python项目详细描述
版权所有(c)2019 Keita Watanabe
兹免费准许任何人取得副本 本软件和相关文档文件(“软件”)的 在软件中不受限制,包括但不限于 使用、复制、修改、转到、发布、分发、再授权和/或出售 软件的副本,并允许软件的用户 在满足以下条件的情况下,可以这样做:
上述版权公告及本许可公告须包括在 软件的拷贝或大部分。
软件按原样提供,无任何形式的保证,明示或 默示的,包括但不限于适销性保证, 适合某一特定目的和非侵犯性。在任何情况下 作者或版权所有者应对任何索赔、损害或其他 责任,无论是在诉讼或合同中,侵权行为或其他,产生于, 不属于或与本软件有关,或使用或与本软件的其他交易有关。 软件。
- 说明:35;<;img src=“docs/spykesim logo/wtext/spykesim wtext.svg”width=“320px”>;
[![pypi](https://img.shields.io/pypi/v/spykesim.svg)](https://pypi.org/project/spykesim/) [![麻省理工学院许可证](http://img.shields.io/badge/license-MIT-blue.svg?style=flat)](LICENSE) [![生成状态](https://travis-ci.org/KeitaW/spykesim.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/KeitaW/spykesim)
spykesim是一个python模块,它提供了测量两个分段的多神经峰值活动之间相似性的函数。
实现了扩展编辑相似度度量。你可以在下面的报纸上找到细节。
生物毒性:https://www.biorxiv.org/content/early/2017/10/30/202655
这个库是算法的重新实现。原始实现可以在[this repo](https://github.com/KeitaW/Chaldea)中找到。
35;支持的操作系统 这个库在ubuntu和macos上测试过。
对于windows用户:请考虑通过[windows subsystem for linux](https://docs.microsoft.com/en-us/windows/wsl/install-win10)使用ubuntu。
35;安装 如果您的环境中没有python3.6,则可以使用[anaconda](https://www.anaconda.com/distribution/)。
[cython](https://github.com/cython/cython)和[numpy](https://github.com/numpy/numpy)需要预先安装,因为它们将在安装过程中使用。
如果尚未安装这些软件包,请运行以下命令: {tt1}$ 也可以通过PIP安装此库: {tt2}$ 或者你可以自己克隆和构建: {tt3}$p>
\ 35;\35;依赖关系
- Python(>;=3.6)
- numpy(需要预先安装)
- cython(需要预先安装)
- scipy
- 全面质量管理
- h5py
-35;教程 您可以在[doc](https://github.com/KeitaW/spykesim/blob/master/docs/tutorial.ipynb)中找到教程。
35;引文 您可以使用以下bib条目引用此作品: {tt4}$p>
-35;
此项目使用以下存储库作为模板。
{a11} 原始许可文件可以在[此处](misc/original license.md)中找到。
平台:未知