几乎是哈迪温伯格测试

snphwe的Python项目详细描述


snphwe:hardy-weinberg平衡的精确检验

在python中重新实现hardy-weinberg均衡的精确snp检验 在Wigginton,Je,Cutler,DJ和Abecasis,GR(2005)中描述 hardy-weinberg平衡的精确检验。AJHG 76:887-893。

这个包只是一个python包装器 c implementation

安装

安装snphwe最简单的方法是通过pip:

pip install snphwe

用法

在python环境中使用snphwe

fromsnphweimportsnphwehom1=10hets=500hom2=5000hwe_p=snphwe(hets,hom1,hom2)

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