SimpleReg是一个专注于研究的工具包,它提供了有助于(医学)图像注册和处理的工具。

SimpleReg的Python项目详细描述


简化

SimpleReg是一个基于Python的开源工具包,它提供了一些有助于(医学)图像注册和处理的工具。提供以下注册框架的接口:

算法和软件由Michael Ebner开发 基于Wellcome/EPSRC Centre for Interventional and Surgical SciencesUniversity College London (UCL)(2015-2019),以及Department of Surgical and Interventional SciencesKing's College London (KCL)(自2019年起)。

如果您有任何问题或意见,请发送电子邮件至michael.ebner@kcl.ac.uk

安装

SimpleReg是在

  • Mac OS X 10.10和10.12
  • ubuntu 14.04和16.04

并测试了Python2.7.12和3.5.2。

安装所需的外部工具和库

通过克隆SimpleReg存储库

  • git clone git@github.com:gift-surg/SimpleReg.git

通过安装所有python依赖项

  • pip install -r requirements.txt

通过运行安装SimpleReg

  • pip install .

通过检查安装

  • python -m nose tests/installation_test.py

许可和版权

版权所有(c)2019迈克尔·埃布纳和撰稿人。 这个框架作为BSD-3-Clause License下的免费开源软件提供。其他许可证可能适用于依赖项。

资金

这项工作部分由UCL Engineering and Physical Sciences Research Council (EPSRC)医学影像学博士培训中心(EP/L016478/1)、创新工程健康奖(Wellcome Trust[WT101957]和EPSRC[NS/A000027/1])资助,并由National Institute for Health ResearchUniversity College London Hospitals (UCLH)生物医学研究中心的研究人员支持。

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