使用matplotlib的简单大脑查看器
simplebrainviewer的Python项目详细描述
SimpleBrainviewer
使用matplotlib的简单大脑查看器
这是什么？不言而喻…这是一个简单的大脑观察者写的 使用matplotlib。如果您只想快速查看卷，则很有用 在Python中。
将添加4D体积查看和体素选择很快…
用法
您可以从python或命令行调用brainviewer（通过nifti文件或任何其他nibabel兼容格式）：
"""
Example
"""
import nibabel as nib
from simplebrainviewer import *
import matplotlib.pyplot as plt
# load a volume
data = nib.load('/a/nifti/file').get_fdata()
# plot the data
simplebrainviewer.plot_brain(data)
命令行用法
usage: brainviewer.py [-h] volume
View a brain volume (Only does 3D, no 4D yet!)
positional arguments:
volume brain volume to view
optional arguments:
-h, --help show this help message and exit
usage: brainviewer.py [-h] volume
View a brain volume (Only does 3D, no 4D yet!)
positional arguments:
volume brain volume to view
optional arguments:
-h, --help show this help message and exit
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