用于读取和或sif文件的库
sifreader的Python项目详细描述
#SIF阅读器
此软件包用于读取和或SIF图像文件。
除了原始图像数据之外，它还提供对光谱的波长轴的访问，以及元数据，例如 曝光时间、增益、记录日期等。图像数据可以读取为numpy数组或 [xarray]（https://xarray.pydata.org/en/stable/）dataarray，它包含图像数据和坐标 单个对象中的轴和标签。对于光谱，光谱轴可以被归类为纳米、波数或 电子伏特。
据我们所知，这是目前唯一可以提取波长信息的python包 只使用纯python和numpy的.sif文件（即不依赖任何和或dll库）。
##要求 numpy（可选xarray，pytest来运行单元测试）
##安装 使用pip安装： ` >pip install sifreader `
##用法
打开文件并打印元数据：
` >file = SIFFile('my_image.sif') >print(file) <sifreader.sifreader.sifreader.SIFFile object at 0x30f9eecc0> Original Filename: E:\test_sequence.sif Date: Thu May 10 12:01:48 2018 ... `
以numpy数组的形式读取文件中包含的单个或所有帧： ` >first_frame = file.read_block(0) >all_frames = file.read_all() `
横轴包含在
###使用可选的xarray软件包
以数据数组的形式读取文件中的所有帧： ` >xarr = file.as_xarray() `
对于光谱：制作一个包含ev中光子能量而不是默认波长的数据数组： ` >spectrum_file = SIFFile('my_spectrum.sif') >xarr = spectrum_file.as_xarray('photon_energy') `
dataarray的一个很好的特性是能够轻松地选择数据并绘制它： `python spectrum_file.as_xarray().sel(frames=0, wavelength=slice(749.5, 768.2)).plot() `
##版本历史记录
- 0.2：增加了对波长信息、xarray导出和单元测试的支持
- 0.1:首次发布
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