用于处理生物序列数据的python工具
seq-tools的Python项目详细描述
#py seq tools
用于处理生物序列、对齐和格式的免费python库。这些库是au公共脚本的一部分，我还没有很好地记录它们。这里的目标是将它们放入一个包中，并使它们得到更好的文档记录。
从长远来看，它们是用python 2编写的，但是最好支持python3的完全兼容，或者将它们完全迁移到python3。
这个包的命令行实用程序有双重用途。1）提供可以在命令行中运行的有用实用程序，2）提供如何使用此包中包含的库的示例。
可以通过
`$seq tools<；cli command>；`
其中cli command是cli模块的名称来访问命令行实用程序。
此发行版中的库请参考[API文档]（https://github.com/jason weirate/py seq tools/blob/master/manual.pdf）
在源目录中，您可以尝试
`$pip安装。`
*fasta
*fastq
*pacbio
*psl
*sam
*graph
*range
*sequence
*simulation
*emitter
*permute
*randomsource
*statistics
*stream
*structure
，详情见[API文档]（https://github.com/jason weirate/py seq tools/blob/master/manual.pdf）。
用于处理生物序列、对齐和格式的免费python库。这些库是au公共脚本的一部分，我还没有很好地记录它们。这里的目标是将它们放入一个包中，并使它们得到更好的文档记录。
从长远来看，它们是用python 2编写的，但是最好支持python3的完全兼容，或者将它们完全迁移到python3。
这个包的命令行实用程序有双重用途。1）提供可以在命令行中运行的有用实用程序，2）提供如何使用此包中包含的库的示例。
可以通过
`$seq tools<；cli command>；`
其中cli command是cli模块的名称来访问命令行实用程序。
此发行版中的库请参考[API文档]（https://github.com/jason weirate/py seq tools/blob/master/manual.pdf）
在源目录中，您可以尝试
`$pip安装。`
*fasta
*fastq
*pacbio
*psl
*sam
*graph
*range
*sequence
*simulation
*emitter
*permute
*randomsource
*statistics
*stream
*structure
，详情见[API文档]（https://github.com/jason weirate/py seq tools/blob/master/manual.pdf）。
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