帮助更平滑地转换到多读fast5文件
seamlessf5的Python项目详细描述
无缝sf5
seamlessf5添加了有用的缺失功能，有助于转换到 牛津纳米孔技术公司 new multi-read FAST5 format。
安装
Seamlessf5可以使用pip安装 对于python 3.5+。
pip install seamlessf5
从tar中的单个fast5文件转换为多读fast5
使用sf5_single_to_multi_fast5包装，ont的single_to_multi_fast5
能够从tar或压缩文件加载单个读取的fast5文件
tar文件。
sf5_single_to_multi_fast5 -i fast5.tar.gz -s save_path --recursive
为多读fast5运行albacore
这个包还安装包装器，sf5_read_fast5_basecaller.py，
sf5_full_1dsq_basecaller.py，和sf5_paired_read_basecaller.py，其中
启用为ont的albacore加载多读fast5文件。
sf5_read_fast5basecaller.py -i multiread-fast5-dir ...
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