scipion-em-cryoef 1.0.5

安装

您需要使用2.0版本的scipion才能运行这些协议。要安装插件，有两个选项：

1. 稳定版本

scipion installp -p scipion-em-cryoef

1. 开发人员版本

   • download repository

   git clone https://github.com/scipion-em/scipion-em-cryoef.git
   

   • install

   scipion installp -p path_to_scipion-em-cryoef --devel
   

CyoEF二进制文件将随插件自动安装，但也可以链接现有的安装。 假定默认安装路径为software/em/cryoEF-1.1.0，如果要更改它，请将scipion.conf`文件中的cryoef\u home设置为安装cryoef的文件夹。要检查安装，只需运行以下scipion测试：

scipion test cryoef.tests.test_protocols_cryoef.TestCryoEF

支持的版本

1.1.0

协议

• orientation analysis

详细手册见software/em/cryoEF-1.1.0/cryoEF_v1.1.0_manual.pdf

参考文献

• 1. Naydenova, K and Russo, CJ “Measuring the effects of particle orientation to improve the efficiency of electron cryomicroscopy” Nature Communications (2017).