读写ImageJ ROI格式
roifile的Python项目详细描述
Roifile是一个Python库，用于读、写、创建和绘制ImageJroi， 一种非文档化的ImageJ应用程序特定格式，用于存储 兴趣，几何图形，路径，文本，和什么图像覆盖。在
| Author: | Christoph Gohlke |
|---|---|
| Organization: | Laboratory for Fluorescence Dynamics, University of California, Irvine |
| License: | BSD 3-Clause |
| Version: | 2020.11.28 |
要求
这个版本已经用以下需求和依赖性进行了测试 （其他版本也可以）：
修订
- 2020.11.28
- 支持组属性。 添加roiread和roiwrite函数（#3）。 在中使用UUID作为ROI的默认名称图像jroi.frompoints（#2）。
- 2020.8.13
- 支持写入ZIP文件。 支持操作系统路径文件名。
- 2020.5.28
- 修复int32到十六进制的颜色转换。 固定闭合路径的坐标。 修复读取没有覆盖的TIFF文件。
- 2020.5.1
- 从计数器拆分位置。
- 2020.2.12
- 初始版本。
示例
从x，y坐标数组创建新的ImagejRoi实例：
>>> roi = ImagejRoi.frompoints([[1.1, 2.2], [3.3, 4.4], [5.4, 6.6]])
>>> roi.coordinates()
array([[1.1, 2.2],
[3.3, 4.4],
[5.4, 6.6]], dtype=float32)
>>> roi.left, roi.left, roi.right, roi.bottom
(1, 1, 5, 6)
将实例导出到ImageJ ROI格式的字节字符串或文件：
^{pr2}$从文件中读取ImageJ ROI：
>>> roi2 = ImagejRoi.fromfile('_test.roi')
>>> roi2 == roi
True
使用matplotlib绘制ROI：
>>> roi.plot()
要从命令行查看存储在ROI、ZIP或TIFF文件中的覆盖图， 运行python -m roifile _test.roi。在
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