一个python包,通过结合用户定义的物理化学特性和序列顺序效应,为dna序列生成各种模式的特征向量
repDNA的Python项目详细描述
重复DNA
repDNA是一个Python包,通过结合用户定义的物理化学特性和序列顺序效应,为DNA序列生成各种模式的特征向量
这个repDNA包是在GPL许可下提供的开源软件有关详细信息,请参阅许可证文件。
重要环节
- 主页:http://bioinformatics.hitsz.edu.cn/repDNA/
- 官方源代码回购:https://github.com/liufule12/repDNA
- 下载版本:http://bioinformatics.hitsz.edu.cn/repDNA/download
- 补充(手册和示例):http://bioinformatics.hitsz.edu.cn/repDNA/supplementary
- 问题跟踪程序:https://github.com/liufule12/repDNA/issues
- 引文:http://bioinformatics.hitsz.edu.cn/repDNA/citation
Python需求
repdna在python 2.7、3.3和3.4下在windows、mac和linux上运行。
安装
如果用户安装了pip(用于安装和管理python包的工具),只需键入:
pip安装repdna
否则,请下载并解压缩repdna包,转到目录,然后键入:
python setup.py安装
或 sudo python setup.py安装