将lif文件加载为numpy数组的python模块
read-lif的Python项目详细描述
读取LIF
将来自lif文件的三维共焦图像作为numpy数组加载。
这段代码最初是由Mathieu Leocmach在colloids包中编写的
安装
- 最方便的方法是：
pip install read_lif - 您还可以在项目目录中包含文件
read_lif
如何使用
importread_lifreader=read_lif.Reader('lif_file.lif')series=reader.getSeries()chosen=series[0]# choose first image in the lif fileimage=chosen.getFrame(T=0,channel=0)# image is a numpy array, first time point & first channel
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