Ley Lab QiIME 2工件快速查看器。
qiime_2_ll_quick_viewer的Python项目详细描述
qiime 2Ley Lab快速查看器
此工具启动一个简单的web服务器，以快速可视化位于data文件夹中的内容 一个Qiime 2可视化工件，即由qiime 2生成的文件，扩展名为*.qzv。
- 自由软件：麻省理工学院许可证
安装
您可以使用pip在python 3.5+环境中安装此工具
pip install qiime_2_ll_quick_viewer
或conda
conda install -c leylabmpi qiime_2_ll_quick_viewer
使用量
给定qiime 2可视化工件，例如demux.qzv，您可以在服务器上运行此命令：
$ qiime_2_ll_quick_viewer --filename /full_path_to/demux.qzv
默认情况下，qiime\u ll_quick_viewer将在端口8089上启动一个Web服务器，但您可以使用选项--port XXXX为所需的服务器进行更改。 然后，您可以使用以下命令打开到服务器上通过qiime_2_ll_quick_viewer打开的远程端口的ssh隧道：
$ ssh -L 8089:localhost:8089 user@your_server
最后，打开浏览器并转到以下地址：http://localhost:8089。
命令选项：
-f, --filename TEXT Full path to a Qiime2 visualization file (*.qzv). [required] -p, --port INTEGER Port to launch the web server. [required] -h, --help Show the help info and exit.
学分
这个包是用Cookiecutter和audreyr/cookiecutter-pypackage项目模板创建的。
历史记录
0.2.8（2017-11-30）
- python 3.5+和tox测试的更新版本。
0.2.7（2017-11-30）
- python 3.5+的更新版本。
0.2.6（2017-11-29）
- 更改为RST文件。
0.2.5（2017-11-29）
- 为conda包生成了基本版本。
0.2.4（2017-11-29）
- 文档已更新为便于标记。
0.2.3（2017-11-28）
- 存储库已迁移到Ley Lab的Github帐户。
0.2.2（2017-11-27）
- 文件更新。
0.2.1（2017-11-27）
- 文件更新。
0.2.0（2017-11-27）
- 包的第一个功能版本。
0.1.0（2017-11-27）
- pypi上的第一个版本。
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