分子模拟交换约定
pyMosaic的Python项目详细描述
Mosaic是一个用于分子模拟应用的模块化数据模型。
Mosaic Python库提供了 马赛克数据项加上HDF5和XML格式的输入/输出。一个 命令行工具提供hdf5和xml之间的转换 表示以及从蛋白质数据库导入的数据 (PDB)。
对于马赛克数据模型的定义和描述 关于python api,请参阅目录“doc”中的文档。
Mosaic Python库需要Python2.7或Python3.2或3.3 加上以下库:
- NumPy 1.6 or later (http://numpy.scipy.org/)
- HDF5 1.8.7 or later (http://www.hdfgroup.org/HDF5/)
- h5py 2.1 or later (http://www.h5py.org/)
- ImmutablePy 0.1 (http://bitbucket.org/khinsen/immutablepy/)
运行测试:
python setup.py test
安装:
python setup.py install