访问pubmed的python库
pymed的Python项目详细描述
pymed-通过python进行pubmed访问
pymed是一个python库,它通过pubmed api提供对pubmed的访问。
为什么是这个图书馆?
pubmed api没有很好的文档记录,以一种高效的方式查询它对研究人员来说太复杂和耗时了。此包装器以一致、可读和高效的方式提供对api的访问。
功能
这个库为您提供以下服务:
- 查询pubmed数据库(使用标准pubmed查询语言)
- 成批请求以获得更好的性能
- 分析和清理检索到的文章
示例
有关完整(工作)示例,请查看此存储库中的examples/
文件夹。实际上,您只需要导入PubMed
类,实例化它,然后使用它来查询:
frompymedimportPubMedpubmed=PubMed(tool="MyTool",email="my@email.address")results=pubmed.query("Some query",max_results=500)
关于API的说明
pubmed api的原始文档可以在这里找到:PubMed Central。Pubmed Central恳请您:
- Do not make concurrent requests, even at off-peak times; and
- Include two parameters that help to identify your service or application to our servers
- tool should be the name of the application, as a string value with no internal spaces, and
- email should be the e-mail address of the maintainer of the tool, and should be a valid e-mail address.
无关联通知和免责声明
此库的作者不是PubMed或其任何子公司或附属公司的附属、关联、授权、背书人或以任何方式与PubMed或其任何子公司或附属公司正式关联。PubMed官方网站可以在https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/找到。