在标准的python 2.7解释器中使用ucsf chimera python api。
pychimera的Python项目详细描述
在任何python 2.7解释器中使用ucsf chimera包
有了pychimera，你可以…
- 使用pychimera script.py根据cli中的chimera运行脚本。
- 在交互式编码会话中启用import chimera，在ucsf chimera之外启用， 包括ipython和jupyter笔记本。
- 启动一个标准的ucsf chimera实例，可以导入所有 使用pychimera --gui的conda或virtualenv包。
希望有用！欢迎反馈！
文档
更新的文档总是可以在readthedocs找到。
致谢
主要基于Greg Couch at chimera-users的想法。
引文
pychimera是一种科学软件，由公共研究资助 （西班牙矿业公司的项目CTQ2014-54071-P，加泰罗尼亚矿业公司 项目2014SGR989和研究拨款2017FI_B2_00168，成本行动CM1306）。 如果你在科学出版物中使用了pychimera，请引用它。会有帮助的 衡量我们研究的影响，确保未来的资金来源！
@article{pychimera2018, author = {Rodríguez-Guerra Pedregal, Jaime and Maréchal, Jean-Didier}, title = {PyChimera: use UCSF Chimera modules in any Python 2.7 project}, journal = {Bioinformatics}, volume = {34}, number = {10}, pages = {1784-1785}, year = {2018}, doi = {10.1093/bioinformatics/bty021}, URL = {http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bty021}, eprint = {/oup/backfile/content_public/journal/bioinformatics/34/10/10.1093_bioinformatics_bty021/1/bty021.pdf}}
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