psf 2019.4.22

要求

• CPython 2.7 or 3.5+
• Numpy 1.11
• Matplotlib 2.2（打印时可选）
• 与python distutils兼容的c编译器（编译）

修订版

2019.4.22

修复设置要求。 修复编译器警告。

2019.1.1

更新版权年。

参考文献

1. 光学系统中的电磁衍射。二。结构 无平面系统中的像场。 理查兹和沃尔夫。程序R Soc Lond A，253（1274），358-3791959。
2. 共焦荧光的焦体光学和实验伪影 相关光谱学。 S T赫斯，W W韦伯。生物物理学杂志（83）2300-172002。
3. 共焦荧光成像的电磁描述 显微镜检查。 T D虎钳，S H WIERSMA。J选择SOC AM A（11）599-6081994年。
4. 光子计数直方图：单光子激发。 B黄，T D佩鲁德，R N扎尔。化学物理化学（5），1523-312004。 辅助信息：观测体积剖面的计算。
荧光显微镜点扩展函数的高斯近似 模型。 B张，J泽鲁比亚，J C奥利沃·马林。申请。光学（46）1819-292007。
5. 关于三维显微镜，反褶积，可视化和分析的svi wiki。 https://svi.nl/NyquistRate
6. 共焦显微镜理论：共焦显微镜的分辨率和对比度 显微镜检查。http://www.olympusfluoview.com/theory/resolutionintro.html

示例

>>> import psf
>>> args = dict(shape=(32, 32), dims=(4, 4), ex_wavelen=488, em_wavelen=520,
...             num_aperture=1.2, refr_index=1.333,
...             pinhole_radius=0.55, pinhole_shape='round')
>>> obsvol = psf.PSF(psf.GAUSSIAN | psf.CONFOCAL, **args)
>>> print('%.5f, %.5f' % obsvol.sigma.ou)
2.58832, 1.37059
>>> obsvol = psf.PSF(psf.ISOTROPIC | psf.CONFOCAL, **args)
>>> obsvol[0, :3]
array([ 1.     ,  0.51071,  0.04397])
>>> # save the image plane to file
>>> obsvol.slice(0).tofile('_test_slice.bin')
>>> # save a full 3D PSF volume to file
>>> obsvol.volume().tofile('_test_volume.bin')

有关详细信息，请参阅源发行版中的psf_example.py文件。