基于prody的python程序，用于预测人类错义变异的致病性。
prody-rhapsod的Python项目详细描述
狂想曲
基于prody的人类致病性预测python程序 错义变体。
使用pip安装最新发布的版本
狂想曲出版于PyPI。要安装rhapsody， 请在终端中使用PIP:
$ pip install -U prody-rhapsody
例如，可能需要手动安装dssp程序 在Linux上键入：
$ sudo apt install dssp
从源安装
rhapsody是用纯python编写的，因此不需要本地编译。
为了安装所有需要的依赖项，我们强烈建议使用conda和create 一个新的环境：
$ conda create -n rhapsody python=3 numpy scikit-learn requests pyparsing matplotlib biopython $ conda activate rhapsody $ pip install prody $ conda install -c salilab dssp
在克隆/分叉rhapsody存储库之后，您可以永久地添加 conda环境的存储库路径：
$ conda develop path/to/local/repository
如果不使用conda，则可以手动安装所有依赖项，然后添加
环境变量PYTHONPATH的存储库位置。为了
例如，在Linux上，只需将以下行添加到您的~/.bashrc：
export PYTHONPATH="path/to/local/repository/:$PYTHONPATH"如果你在Windows上运行，请遵循以下操作 tutorial。
运行初始设置
安装后，请运行：
import rhapsody as rdrd.initialSetup()
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