我的个人函数和Python编程工具。
prestools的Python项目详细描述
预刀具
我的个人函数和Python编程工具。在
- 免费软件：麻省理工学院许可证
- 文档：https://prestools.readthedocs.io
- GitHub回购：https://github.com/robertopreste/prestools
特点
针对不同任务的几个现成功能：
- 生物信息学（prestools.bioinf）
- 数据聚类（prestools.clustering）
- 绘图（prestools.graph）
- 其他（prestools.misc）
有关详细信息，请参阅文档的Usage部分。在
学分
此包是用Cookiecutter和cc-pypackage项目模板创建的。在
历史
0.1.0（2019-03-07）
- 第一个开发版本。在
0.1.1（2019-03-14）
- 添加用于聚类数据的函数。在
0.1.2（2019-03-15）
- 在prestools.bioinf和相关测试中添加hamming_distance()和mutate_sequence()函数
- 干净的代码样式。在
0.1.3（2019-03-19）
- 为bioinf和misc模块添加命令行接口命令和相关测试
- 在prestools.misc中添加filter_type()函数及相关测试
- 干净的代码样式。在
0.1.4（2019-03-23）
- {$tt4}相关测试^$tt12}。在
0.1.5（2019-04-05）
- 在prestools.misc中添加equal_files()函数及相关测试
- 更新docstrings。在
0.1.6（2019-04-11）
- 在prestools.plotting中添加random_image()函数和CLI。在
0.1.7（2019-04-20）
- 在prestools.misc和相关测试中添加benchmark()函数。在
0.1.8（2019-04-26）
- 将pm.benchmark()函数改为decorator
- 在prestools.bioinf和相关测试中添加几个距离计算函数
- 在prestools.bioinf中重新格式化代码。在
0.1.9（2019-04-27）
- 向bioinfCLI命令和相关测试添加距离函数。在
0.1.10（2019-05-06）
- 将plottinglibrary name更改为graph（以避免别名与pandas_评测冲突）。在
0.1.11（2019-05-07）
- 修正docstring和类型提示
- 更新文档。在
0.1.12（2019-05-08）
- 将apply_parallel函数添加到prestools.misc。在
0.1.13（2019-06-22）
- 向reverse_complementbioinf函数添加短版本参数。在
0.1.14（2019-07-03）
- 添加learn模块及相关测试
- 从graph模块中删除random_image
- 干净的代码。在
0.2.0（2019-08-14）
- 将rpkm和quantile_norm函数添加到prestools.bioinf
- 将reduce_xaxis_ticks和reduce_yaxis_ticks函数添加到prestools.graph
- 将flatten_image移到prestools.graph
- 删除prestools.learn
- 更新相关测试
- 修复文档和API。在
0.2.1（2019-09-07）
- 将plot_confusion_matrix添加到prestools.graph
- 增加相关测试
- 删除对Python的支持<；3.6
- 更新要求
- 更新文档。在
- 项目
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