通过网络进行磷酸蛋白质组分离
photon-ptm的Python项目详细描述
[！[生成状态]（https://travis-ci.org/jdrudolph/photon.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/jdrudolph/photon）
photon是[perseus]（https://www.perseus-framework.org）软件的一部分，用于从perseus版本1.6.2.1开始的蛋白质组学分析。
[！[讲解光子背后的主要概念的讲座]（https://img.youtube.com/vi/JXhZyWA3JIc/0.jpg)](https://www.youtube.com/watch?v=JXhZyWA3JIc）
#利用蛋白质相互作用网络从大规模磷酸蛋白质组数据阐明信号通路
磷酸蛋白质组学实验通常识别蛋白质中两种或多种细胞状态之间差异磷酸化的位点。然而，由于缺乏能够将位点特异性信息转化为活性蛋白和信号网络的全球图谱的方法，尤其是由于磷酸化蛋白组常常样本不足，因此这些数据的解释受到了阻碍。在这里，我们描述光子，一种解释蛋白质-蛋白质相互作用网络捕获的信号环境中磷酸化数据的方法，以识别活性蛋白质和途径并精确定位功能性磷酸化位点。我们应用光子解释现有的和新的磷酸化蛋白质组数据与表皮生长因子和胰岛素反应。光子在很大程度上优于广泛使用的截止方法，提供了更符合当前生物学知识的高重复性预测。总之，光子克服了从大规模磷酸蛋白质组数据中描绘信号通路的基本挑战，从而能够将环境信号转换为下游细胞反应。
[发布链接]（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28009266）
#安装和教程
按照[安装说明]（docs/perseus/installation.md）和 [学习]（docs/perseus/tutorial.md）如何从英仙座内部使用光子。
#公式
请随时就使用的代码和公式提出问题。[此处]（docs/formulas.ipynb）您可以找到更详细的信息。
#故障排除 请打开问题[此处]（https://github.com/jdrudolph/photon/issues），或 如果您在安装或使用photon时遇到问题，请直接与我联系。
#执照 如果当前的[许可证]（/licence.txt）不适合您的需要， 请与我联系以获取其他许可选项。
#挫伤 欢迎解释光子的代码和文档！
欢迎加入QQ群-->： 979659372
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