用于查询hpo数据库和其他一些源的工具
phizz的Python项目详细描述
[![Build Status](https://travis-ci.org/moonso/phizz.svg)](https://travis-ci.org/moonso/phizz)
# phizz #
Tool to query HPO and OMIM
## Installation ##
```pip install phizz```
or
```
$git clone https://github.com/moonso/phizz.git
$cd phizz
$python setup.py install
```
## 用法:使用命令行实用程序:
````
指定输出文件的路径
-j,TojJSON如果输出应该是JSON格式
——请帮助显示此信息。< BR/>< BR/>< BR/> > $PHIZ查询-M OMIM:615373
HPO ID描述:BR/Hp:0011675心律失常
HP:0001644扩张型心肌病
HP:0001653二尖瓣反流
Hp:000000 6常染色体显性遗传。继承性
hp:0001711左心室异常
```
to json:
```
$phizz query--hpo-u-term hp:0000002--to-json
[{“hpo-term”:“hp:0000002”,“description”:“身高异常”}]
`````
>在python中导入:在[1]:在[2]:phizz.pyzz中导入phizz
>in[2]:phizz.pyzz.pyzz.query疾病(['omimm:6153373']
out[2]:
>[{'description''u'心律失常','hpo'u术语':u'hp:0011675'},
{{'descrip'>{'descrip‘description':u'u'扩张型心肌病','hpo'u'u'u'4'},
{'说明':u‘二尖瓣返流’,‘hpo’项:u‘hp:0001653’,
{description':u‘常染色体显性遗传’,‘hpo’项:u‘hp:0000006’,
{description':u‘左心室异常’,
‘hpo’项:u‘hp:0001711’,
```
# phizz #
Tool to query HPO and OMIM
## Installation ##
```pip install phizz```
or
```
$git clone https://github.com/moonso/phizz.git
$cd phizz
$python setup.py install
```
## 用法:使用命令行实用程序:
````
指定输出文件的路径
-j,TojJSON如果输出应该是JSON格式
——请帮助显示此信息。< BR/>< BR/>< BR/> > $PHIZ查询-M OMIM:615373
HPO ID描述:BR/Hp:0011675心律失常
HP:0001644扩张型心肌病
HP:0001653二尖瓣反流
Hp:000000 6常染色体显性遗传。继承性
hp:0001711左心室异常
```
to json:
```
$phizz query--hpo-u-term hp:0000002--to-json
[{“hpo-term”:“hp:0000002”,“description”:“身高异常”}]
`````
>在python中导入:在[1]:在[2]:phizz.pyzz中导入phizz
>in[2]:phizz.pyzz.pyzz.query疾病(['omimm:6153373']
out[2]:
>[{'description''u'心律失常','hpo'u术语':u'hp:0011675'},
{{'descrip'>{'descrip‘description':u'u'扩张型心肌病','hpo'u'u'u'4'},
{'说明':u‘二尖瓣返流’,‘hpo’项:u‘hp:0001653’,
{description':u‘常染色体显性遗传’,‘hpo’项:u‘hp:0000006’,
{description':u‘左心室异常’,
‘hpo’项:u‘hp:0001711’,
```