TimeSeries数据库

PhilDB的Python项目详细描述


PHILDB项目

DOIPYPI VersionPYPI StatusPYPI Python versionsPYPI LicenseBuild StatusAppveyor StatusCode Coverage

timeseries数据库项目:用于存储可能更改的timeseries 数据。例如水文数据,如径流数据,其中 随着质量控制流程的改进 随时间记录的数据集。

phildb应该能够以 熊猫。在这个时候,只有每天的数据都经过了广泛的测试 一些有限的日常使用。

有关phildb设计的更多信息,请参见论文: PhilDB: the time series database with built-in change logging。 本文探讨了现有的时间序列数据库解决方案,讨论了 phildb的动机,描述了phildb的架构和哲学 软件,包括infloxdb、phildb和scidb之间的评估。

依赖性

需要Python2.7或更高版本(主要在MacOSX和Linux上使用Python2.7和Python3.5进行测试)。 测试套件使用travis ci和python 2.7、3.4、3.5和3.6在linux上运行。 测试套件使用Appveyor和Python3.4在Windows上运行。

所有python依赖项都记录在python_需求中 文件。

安装

phildb是pip可安装的。

最新的稳定版本可以通过pypi安装:

pip install phildb

最新的稳定版本也可以通过conda安装:

conda install -c amacd31 phildb

最新的开发版本可以通过github安装:

pip install git+https://github.com/amacd31/phildb.git@dev

最新的开发版本可以从conda安装,安装方式为:

conda install -c amacd31/label/dev phildb

开发环境

在makefile中,开发环境的许多进程(包括测试和文档生成)已经自动化。

virtualenv包可用于创建 必需的python包。

创建安装了依赖项的虚拟环境:

make venv

测试一切正常:

make test

制作文档:

make docs

在doc/build/html/index.html查看生成的文档

有关其他详细信息,请参阅安装文件。

用法

创建新的phildb

phil-create new_tsdb

打开新创建的phildb

phildb new_tsdb

如果使用make构建的开发环境,请将其与添加phildb工具一起加载到您的路径:

. load_env

示例

有关设置test phil数据库的代码,请参见examples目录 不同的数据集。每个示例都附带一个自述文件,概述 步骤获取一些数据并加载它。每个 示例可以用作准备TimeSeries数据库和 加载数据。

examples/hrs/example还包含一个示例脚本(autocorr.py) 使用phildb处理hrs数据。脚本计算 hrs数据集中所有streamflow时间序列的自动关联。

目前有三组示例代码,acorn sat, bom_观察,和小时。

橡实-sat

ACORN-SAT Example.ipynb位于examples/acorn sat中,演示了加载最小值 澳大利亚112个车站日最高气温记录。

本例中使用的数据集是澳大利亚气候观测 参考网络-地表空气温度(ACORN-SAT),见 澳大利亚气象局网站 ACORN-SAT website

物料清单观察值

Bureau of Meterology observations example.ipynb 位于Examples/Bom_Observations演示加载 72小时观测json文件中的半小时气温数据。

本例中使用的数据是来自 澳大利亚气象局网站(如链接的json文件 在本页:Sydney Airport observations

小时

HRS Example.ipynb 位于examples/hrs演示每日加载 221个径流站的流量数据ar在澳大利亚附近。

本例中使用的数据集是水文参考站 (hrs)澳大利亚气象局网站上的数据集 HRS website

这个例子还包括一个脚本来计算自相关 对于hrs数据集中的所有streamflow时间序列。

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