基于Pandas的VCF、BED和SAM文件的数据处理程序
pdbio的Python项目详细描述
pdbio公司
基于Pandas的VCF、BED和SAM文件的数据处理程序
安装
$ pip install -U pdbio
Python API
API调用示例
^{pr2}$命令行界面
命令示例
# Convert VCF data into sorted TSV data $ pdbio vcf2csv --sort --tsv test/example.vcf # Convert VCF data into expanded CSV data $ pdbio vcf2csv --expand-info --expand-samples test/example.vcf # Sort VCF data by CHROM, POS, and the other $ pdbio vcfsort test/example.vcf
运行pdbio --help
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