nda-tools 0.1.20

data/1g_file.fastq

然后您将输入的目录是：

用户/[youruser]/documents/multipledataypes

您不应该将"data/"文件夹作为目录名的一部分。

要开始验证，必须输入文件列表（如果不在当前目录中，则为文件路径），并用空格分隔：

vtcmd MultipleDataTypes/genomics_sample03.csv testdata/with_associated_files/genomics_sample03.csv 

如果您的数据包含清单文件，则必须输入找到清单文件的目录，并用空格隔开：

vtcmd submission_data/sample_imagingcollection01.csv  -m submission_data/Manifests

如果有关联的文件，请输入找到它们的目录，用空格隔开：

vtcmd MultipleDataTypes/genomics_sample03.csv testdata/with_associated_files/genomics_sample03.csv -l MultipleDataTypes testdata/with_associated_files 

如果文件位于当前工作目录以外的其他位置，则必须输入完整的 文件路径：

vtcmd MultipleDataTypes/genomics_sample03.csv testdata/with_associated_files/genomics_sample03.csv -l Users/[youruser]/Downloads/SubmissionData testdata/with_associated_files

如果关联的文件位于s3中，则必须包含bucket名称、访问密钥和密钥。 访问和密钥也可以存储在settings.cfg文件中。

vtcmd MultipleDataTypes/genomics_sample03.csv testdata/with_associated_files/genomics_sample03.csv -s3 my_bucket -ak XXXXXXXXXXXXXX -sk XXXXXXXXXXXXXX

注意：您也可以上传本地和s3中保存的相关文件。只需确保包含 保存本地文件（-l path/to/local/associated/files）

要创建包，请在命令行参数的末尾输入"-b"。你也可以输入你的用户名，密码， AWS凭据、集合ID或备用终结点标题，以及提交的标题和描述，或者您可以输入 稍后在客户机提示时提供信息。直到所有文件都被验证并且所有关联的文件 位于本地驱动器或S3中，客户端将不会开始生成提交包。

包提交和上载完成后，您将在收件箱中收到来自保密协议的电子邮件，确认 提交成功。

如果你的文件上传被中断，你可以重新开始你的提交，如果你有提交ID，从中断的地方开始， 在首次创建提交时提供给您的。要使用客户端重新启动提交，请输入 以下命令：

python --version

此时，您还可以选择包括用户名、密码、aws凭据和目录列表，或者在提示时输入 由客户提供。

下载数据

要下载数据，应该使用downloadcmd命令。这提供了几个选项来下载您的nda打包数据 或数据的子集。所有文件都会自动下载到~/aws\u downloads文件夹，但您可以通过 在命令行中指定一个新目录以保存文件。

请注意，数据一次传输的最大限制是5TB。

所有包数据

通过传递包id:

下载命令<；包id>；-dp

注意：除非您用关联文件创建了NDA包，否则它不会下载关联文件。下载关联的步骤 文件如下。