分子设计工具包：笔记本中的简单化学模拟、可视化和云计算
moldesign的Python项目详细描述
[！[PYPI版本]（https://badge.fury.io/py/moldesign.svg）]（https://badge.fury.io/py/moldesign）<；a href=“https://badge.fury.io/gh/autodesk%2fmollecular design toolkit”style=“FONT FAMILY:'helvetica neue'，helvetica，arial，sans serif；背景色：rgb（70，61，84）；“>；
<；img src=“https://badge.fury.io/gh/autodesk%2fmollecular design toolkit.svg”a lt=“github version”height=“20”>；&；nbsp；
<；/a>；<；a href=“https://github.com/autodesk/molecular-design-toolkit/blob/master/license”style=“FONT FAMILY:”Helvetica neue'，Helvetica，arial，sans serif；背景颜色：RGB（70，61，84）；“>；<；img src=”https://img.shields.io/badge/license apache%202 blue.svg“>；<；/a>；[！[Gitter]（https://badges.gitter.im/molecular design toolkit/lobby.svg）]（https://gitter.im/molecular-design-toolkit/lobby？utm_source=badge&utm_medium=badge&utm_campaign=pr badge）
**立即尝试：**[！[绑定器]（http://mybinder.org/badge.svg）（http://mybinder.org/repo/avirshup/mdt-gallery-test）
该工具包旨在通过将成熟的开源模拟包与可读的抽象api、jupyter笔记本可视化和本机云计算集成起来，降低您与科学之间的障碍。运行：
``shell
pip install moldesign
python-m moldesign intro
````
注意：根据python在系统上的安装方式，有些用户可能需要以根用户身份安装包：`sudo pip install moldesign`.
开始的最佳方法是使用将弹出的示例“python-m moldesign intro”。有关完整的API文档，请参见[文档]（https://autodesk.github.io/molecular-design-toolkit/），开发说明和其他安装场景。
=mdt。从pdb（'3aid'）
protease.draw（）
`````
>创建一个小分子并放松它的几何结构：
``` python
mool=mdt。从人名（'联吡啶’）
mol.set_能量模型（mdt.models.rhf（basis'sto-3g’）
min_轨迹=mol.minimum（nsteps=20）
min_轨迹。绘制轨道（
```````
>
深入的例子，请参见内置的示例笔记本（运行“python-m moldesign intro”启动）。
\##贡献
有关详细信息，请参见[贡献.md]（贡献.md）。请注意，[笔记本分子可视化]（https://github.com/autodesk/notebook-molecular-design）库和[pycloudcomputecannon]（https://github.com/autodesk/py-cloud-compute-cannon）也在该项目的保护伞下开发。
2016 autodesk inc.
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