基于cobrapy的微生物群落建模。
micom的Python项目详细描述
micom是一个用于微生物代谢建模的python包 在 Human Systems Biology Group的 奥斯巴多教授在National Institute of Genomic Medicine Mexico和 Gibbons Lab在Institute for Systems Biology处。
micom允许您从输入列表构建社区模型 眼镜蛇模型和管理个人和个人之间的交换通量 与环境有关。它明确说明了 社区中的个人，因此可以合并来自16srrna的数据 测序实验。它允许使用多种算法进行优化 利己增长率最大化的权衡模型 合作目标。
归因
micom在recent preprint中描述，您可以引用它。 如果您有任何问题，请联系我们oresendis（at）inmegen.gob.mx。谢谢：微笑：
安装
micom在pypi上可用，可以通过
安装pip install micom
开始
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