根据来自onecodex的分类法分配筛选读取。
metasort的Python项目详细描述
#metasort
一个使用onecodex api的数字健康黑客周末项目。
根据onecodex的分类分配过滤读取。
上载一个快速（a/q）文件并下载按物种排序的单个文件。
>设置one codex api key
>导出onecodex api key=f83xxxxxxxxxxxxxxxxxx78
source venv/bin/activat
pip install metasort
<尾
19648/路径/到/出/细胞有机体。fq
30016/路径/to/outdir/金黄色葡萄球菌亚种。金黄色葡萄球菌。fq
81680/path/to/outdir/outdir/细菌。fq
126364/path/to/outdir/表皮葡萄球菌。fq
398684/path/to/outdir/葡萄球菌/葡萄球菌。fq
2030880/path/to/outdir/outdir/firmicutes/firmicutes.fq
3195432/path/to/outdir/outdir/outdir/金黄色葡萄球菌。fq
；web
>用法：
<<<
<<
<<<
<
<
pip安装-r要求
python webapp.py
现场演示：
[https://genome sort.herokapp.com/]（https://genome sort.herokapp.com/）
一个使用onecodex api的数字健康黑客周末项目。
根据onecodex的分类分配过滤读取。
上载一个快速（a/q）文件并下载按物种排序的单个文件。
>设置one codex api key
>导出onecodex api key=f83xxxxxxxxxxxxxxxxxx78
source venv/bin/activat
pip install metasort
<尾
19648/路径/到/出/细胞有机体。fq
30016/路径/to/outdir/金黄色葡萄球菌亚种。金黄色葡萄球菌。fq
81680/path/to/outdir/outdir/细菌。fq
126364/path/to/outdir/表皮葡萄球菌。fq
398684/path/to/outdir/葡萄球菌/葡萄球菌。fq
2030880/path/to/outdir/outdir/firmicutes/firmicutes.fq
3195432/path/to/outdir/outdir/outdir/金黄色葡萄球菌。fq
；web
>用法：
<<<
<<
<<<
<
<
pip安装-r要求
python webapp.py
现场演示：
[https://genome sort.herokapp.com/]（https://genome sort.herokapp.com/）
欢迎加入QQ群-->： 979659372
