用于分析生物数据的包。
MAGINE的Python项目详细描述
magine是一个分析定量多组分数据的框架。 它设计用于处理多样本（时间点）和多组分 （rnaseq、无标签蛋白质组学等）。用户可以访问工具驱动的 围绕他们的实验数据。提供生物富集分析 网络建设和各种可视化方法。
文档
手册可在http://magine.readthedocs.io在线获取。
安装
安装Python
我们推荐的方法是使用Anaconda，它是 python的发行版包含了 需要启动软件。如果您是Mac或Linux用户，请 以前使用过python，现在可以使用pip安装 软件，你可能想跳过这一步，使用你现有的Python。 安装。
anaconda有一个简单的图形安装程序，可以下载 从https://www.anaconda.com/distribution/#download-section-选择 您的操作系统并下载python 3.7版本。这个 默认的安装程序选项通常是合适的。
打开终端
我们将使用conda安装大多数软件包：
$ conda create -n magine_env python=3.7 $ conda activate magine_env $ conda config --add channels conda-forge $ conda install jinja2 statsmodels networkx graphviz $ conda install -c marufr python-igraph
windows用户：请下载并安装igraph和pycairo 使用Christoph Gohlke提供的车轮文件，可在 https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/。通过pip下载并安装。
安装magine
使用pip安装非常简单-在终端中键入以下内容：
$ pip install magine
启动python和magine
在终端或命令提示符下键入
$ jupyter notebook
然后您将看到python提示符。键入import magine以尝试 正在加载magine。如果没有出现错误消息，则下一个python 出现提示，您已成功安装magine！
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