一个灵活快速的混合模型工具箱
limix的Python项目详细描述
limix
LimIX是一个灵活、高效的Python接口线性混合模型库。 它包括用于
- 单变量关联和交互测试
- 线性混合模型的方差分解分析
- 关联和交互集测试
- 用于统计分析、基本I/O和绘图的不同实用程序。
我们有大量的图书馆。 如果您需要进一步的帮助或想讨论任何与limix相关的事情，请加入我们的forum并与我们聊天。 如果您发现了一个bug，请报告它正在创建一个issue。
安装
NOTE: We will be maintaining limix 2.0.x for a while, in case you find some missing feature in limix 3.0.x. If that is the case, please, type
pip install "limix <3,>=2"in your terminal.
安装简单，可在MacOS、Linux和Windows上运行：
pip install limix
如果您已经有limix，但希望将其升级到最新版本：
pip install limix --upgrade
交互式教程
- eQTL（需要limix 2.0.x）
- Struct-LMM（需要limix 2.0.x）
运行测试
安装后，您可以对其进行测试
python -c "import limix; limix.test()"只要你有pytest。
作者
许可证
这个项目是根据Apache License License授权的。
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