kegg数据库rest api的基本前端
keggrest的Python项目详细描述
kegg rest
==
rest api的实现,以访问kegg数据库
是所有其他调用的基础。
将其余调用的片段作为参数。
kegglink(db1,db2,**kwargs)->;(dict,dict)
返回列表的两个字典
,该字典给出了数据库的每个元素与另一个
keggconv(db1,db2,**kwargs)->;(dict,dict)
在一个kegg数据库和外部数据库之间进行转换的方式。目前支持的
是基因的uniprot、ncbi-gi和ncbi-geneid以及化合物的pubchem和chebi
。返回两个查找表(dicts)two convert
从一个字典到另一个字典的转换
>返回特定数据库中特定有机体的所有元素,
以字典元素的形式:description
keggget(element,option='',**kwargs)->;dict
返回所需对象的描述字典。
可能的选项有:aaseq ntseq mol kcf image kgml
keggbrite(britename,option='',**kwargs)->;dict of dicts
分析brite本体并返回字典。
仍处于beta版本,最多可工作三个层次结构级别。
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rest api的实现,以访问kegg数据库
是所有其他调用的基础。
将其余调用的片段作为参数。
kegglink(db1,db2,**kwargs)->;(dict,dict)
返回列表的两个字典
,该字典给出了数据库的每个元素与另一个
keggconv(db1,db2,**kwargs)->;(dict,dict)
在一个kegg数据库和外部数据库之间进行转换的方式。目前支持的
是基因的uniprot、ncbi-gi和ncbi-geneid以及化合物的pubchem和chebi
。返回两个查找表(dicts)two convert
从一个字典到另一个字典的转换
>返回特定数据库中特定有机体的所有元素,
以字典元素的形式:description
keggget(element,option='',**kwargs)->;dict
返回所需对象的描述字典。
可能的选项有:aaseq ntseq mol kcf image kgml
keggbrite(britename,option='',**kwargs)->;dict of dicts
分析brite本体并返回字典。
仍处于beta版本,最多可工作三个层次结构级别。