ilus:生成WGS/WES分析管道的便捷工具。

ilus的Python项目详细描述


^{str1}$Ilus是全基因组重测序(WGS)和全外显子测序数据(WES)分析的便捷管道生成器。在

安装

ilus由Python编写并在PyPI中发布。只需运行以下命令即可进行安装:

pip install ilus

如果一切顺利,可以在命令行终端中键入ilus。在

快速入门

ilus中有几个函数

^{pr2}$

您将看到所有函数:

usage: ilus [-h]{WGS,genotype-joint-calling,VQSR} ...

ilus: A WGS analysis pipeline.

optional arguments:
    -h, --help            show this help message and exit

ilus commands:
{WGS,genotype-joint-calling,VQSR}
    WGS                 Creating pipeline for WGS(from fastq to genotype VCF)
    genotype-joint-calling Genotype from GVCFs.
    VQSR                VQSR

以下是ilus如何创建WGS/WES管道的所有中文README。在

英文版就要来了。在

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

推荐PyPI第三方库


热门话题
IE中的java跨域cookie问题   重复java中已经满足的循环   编译java RMI服务器时出错   JavaServlet POST中作为参数传递的javascript大型JSON数组数据为空   java片段未每次刷新/调用   java无法编译。错误消息   java如何构造大型类?   java Hibernate:TableThingsDB。事情并不存在   java如何操作从匹配项创建的数组。发现   循环以搜索和显示数组Java的某些部分   加载或注册SQLite JDBC驱动程序时出现java问题   活动和服务之间的java连接   JavaGWTG2D:ie8中的drawImage   java在安卓中设置hessian阈值   在Tomcat中使用Logback时发生java错误