ilus:生成WGS/WES分析管道的便捷工具。
ilus的Python项目详细描述
^{str1}$Ilus是全基因组重测序(WGS)和全外显子测序数据(WES)分析的便捷管道生成器。在
安装
ilus由Python编写并在PyPI中发布。只需运行以下命令即可进行安装:
pip install ilus
如果一切顺利,可以在命令行终端中键入ilus。在
快速入门
ilus中有几个函数:
^{pr2}$您将看到所有函数:
usage: ilus [-h]{WGS,genotype-joint-calling,VQSR} ... ilus: A WGS analysis pipeline. optional arguments: -h, --help show this help message and exit ilus commands: {WGS,genotype-joint-calling,VQSR} WGS Creating pipeline for WGS(from fastq to genotype VCF) genotype-joint-calling Genotype from GVCFs. VQSR VQSR
以下是ilus如何创建WGS/WES管道的所有中文README。在
英文版就要来了。在
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