idtrackerai 3.0.17a0

idtracker.ai（v3）

这是跟踪软件的新版本。

ai是一个用于实验室条件的多动物跟踪软件。这项工作发表在自然方法[1]（pdf这里）

idtrackerai v3有什么新功能？

• 基于pyforms的新图形用户界面（gui）
• 使用终端模式从命令行跟踪视频
• 保存视频的预处理参数，并使用终端模式加载它们。这将使您无需与图形用户界面交互即可按顺序跟踪成批视频。
• 使用本地设置.py文件更改高级跟踪参数。
• 改进了跟踪期间的内存管理。识别图像和像素集可以是 现在保存在RAM或磁盘中。使用local_settings.py文件设置这些参数。将图像和像素保存在磁盘中会使跟踪速度变慢，但可以使用较少的RAM内存跟踪较长的视频。
• 改进了数据存储管理。使用local_settings.py文件中的参数data_policy来决定跟踪后要保存哪些文件。例如，如果您只需要轨迹，这将防止您存储大量不必要的文件。
• 基于python视频注释器的新gui改进了对轨迹的验证和校正
• 代码内部结构的全面改进。
• 已修复多个错误。

硬件要求

idtracker.ai（v3）已在具有以下规格的计算机中进行了测试：

• 操作系统：64位GNU/Linux Mint 19.1和Ubuntu18.4
• CPU:Core（TM）I7-7700K CPU@4.20GHz 6核Intel（R）或Core（TM）I7-6800K CPU@3.40GHz 4核
• GPU:Nvidia Titan X或GeForce GTX 1080钛
• RAM:32GB-128GB（视视频需要而定）。
• 磁盘：1TB固态硬盘

idtracker.ai在Python3.6中编码，并使用TensorFlow库 （版本1.13）。由于深度神经网络的大量使用，我们建议使用具有支持计算能力3.0或更高的专用nvida gpu的计算机。请注意，使用tensorflow库的部分算法在使用gpu时会运行得更快。

安装。

查看文档中安装说明的更完整版本。

最稳定版本的idtracker.ai可以使用以下选项之一从pypi安装：

1.gui和gpu支持（i）：此选项将安装idtrackerai（此存储库）、idtrackerai应用程序和tensorflow 1.13.1，并支持gpu。请注意，您需要有NVIDIA驱动程序、CUDA 10.0和CUDNN 7.6才能正常工作。

pip install idtrackerai[gui,gpu]

2.图形用户界面和GPU支持（ii）：如果您不想自己安装CUDA 10.0和CUDNN 7.6，您可以在Conda环境中安装idtracker.ai，然后在Conda包管理器的GPU支持下安装TensorFlow 1.13。

pip install idtrackerai[gui]
conda install tensorflow-gpu=1.13

3.不支持图形用户界面和GPU。：如果要在计划仅从终端运行IDTrackerai的计算机中安装IDTrackerai，请使用此选项（请参阅下面的操作方法）。

pip install idtrackerai[gpu]

如果您不想自己安装cuda 10.0和cudnn，请安装一个co的idtrackerai insiderNDA环境，然后在Conda软件包管理器的GPU支持下安装TensorFlow 1.13。

pip install idtrackerai
conda install tensorflow-gpu=1.13

4.图形用户界面和无GPU支持：如果您只想使用图形用户界面保存.json参数文件，或者如果您想使用"无标识跟踪"功能跟踪动物，请使用此选项。在这种情况下，您不需要GPU。

pip install idtrackerai[gui]

5.没有图形用户界面和GPU支持：如果您只想使用idtracker.ai来操作idtracker.ai对象或作为另一个项目的附加组件，请使用此选项：

pip install idtrackerai

测试安装。

安装idtracker.ai后，您可以运行以下选项之一测试安装。

1.GPU支持：如果使用任何GPU支持选项安装它，请运行：

idtrackerai_test

2.无GPU支持：如果使用"无GPU"选项安装，则运行：

idtrackerai_test --no_identities

此测试将加载大约500MB的示例视频，并使用参数的默认值执行idtracker.ai。要将视频和测试结果保存在特定文件夹中，请在命令中添加以下选项。

idtrackerai -o path/to/folder/where/to/save/results

为开发人员安装。

即将推出

打开或运行idtracker.ai

如果您安装了带有gui支持的idtracker.ai，则可以运行以下命令来启动gui。

pip install idtrackerai[gui,gpu]

pip install idtrackerai[gui,gpu]