用于探索和分析基因组数据的可扩展库。

hail的Python项目详细描述


冰雹

Zulip

Hail是一个开源的、通用的、基于python的数据分析工具,具有用于处理基因组数据的其他数据类型和方法。

hail是按比例构建的,对多维结构化数据有一流的支持,就像基因组相关研究(gwas)中的基因组数据一样。

冰雹暴露为Python库,使用原语进行分布式查询,并在Scala、^ {A3}和日益增加的C++中实现线性代数。

有关使用hail的更多信息,请参见documentation

社区

hail已被广泛应用于学术界和工业界,包括作为genome aggregation databaseUK Biobank rapid GWAS的分析平台。进一步了解Hail-powered science

贡献

如果您想讨论或参与方法或基础设施的开发,请:

hail使用一种持续的软件开发部署方法,这意味着我们经常添加新的特性。我们通过Discussion Forum向用户更新hail的更改。我们建议您在论坛上创建一个帐户,以便您也可以订阅这些更新。

维修人员

冰雹是由位于Broad Institute of MIT and HarvardMassachusetts General HospitalAnalytic and Translational Genetics UnitNeale lab的团队维持的。

联系冰雹小组^{}.

Citing Hail

If you use Hail for published work, please cite the software. You can get a citation for the version of Hail you installed by executing:

^{pr 1}$

Which will look like:

^{pr 2}$
Acknowledgements

The Hail team has several sources of funding at the Broad Institute:

  • The Stanley Center for Psychiatric Research, which together with Neale Lab has provided an incredibly supportive and stimulating home.
  • Principal Investigators Benjamin Neale and Daniel MacArthur, whose scientific leadership has been essential for solving the right problems.
  • Jeremy Wertheimer, whose strategic advice and generous philanthropy have been essential for growing the impact of Hail.

We are grateful for generous support from:

  • The National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
  • The National Institute of Mental Health
  • The National Human Genome Research Institute
  • The Chan Zuckerburg Initiative

We would like to thank Zulip寻求支援 提供免费托管的开源,YourKit,LLC慷慨提供 开放源码开发的YourKit Java Profiler免费许可证。

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

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