一个有效过滤morpheus搜索引擎结果的软件工具。
groupfilter的Python项目详细描述
groupfilter-有效过滤morpheus搜索引擎结果的软件工具
groupfilter是一个基于 pytecomics(http://pythonhosted.org/pyteomics/)包 增加morpheus搜索引擎结果的fdr阈值以上的标识数。
依赖关系
- pytecomics(>;=3.0)
- 努比
如何安装
- best way to install groupfilter is with ^{tt1}$: ^{tt2}$.
- alternatively, you can download source code for each library and run ^{tt3}$ for each of them.
- There may be other ways to install ^{tt4}$, depending on your platform.
如何使用
groupfilter.py file1.tsv [file2.tsv ...] db.fasta
- 位置参数:
morpheus psm文件的文件列表
指向fasta文件的db.fasta路径
链接
- PYPI:https://pypi.python.org/pypi/groupfilter
- Bitbucket回购和发行跟踪器:https://bitbucket.org/levitsky/groupfilter
- 邮件列表:pyteomics@googlegroups.com