安装葡萄rna-seq管道的构建配方
grape.recipe.pipeline的Python项目详细描述
grape.recipe.pipeline包是用于 配置grape，用于处理和分析rna序列数据的管道。 rna-seq是用于细胞rna测序的新一代测序技术。 要运行grape，您需要以fasta、fastq或预先对齐的sam/bam格式读取文件， 以及基因组和基因转录注释。首先，葡萄有品质 控制并将读取结果与基因组对齐。葡萄的核心是 转录组。葡萄量化基因和转录表达水平，估计 外显子包含水平，为您发现新的剪接形式，并包括一个强大的 允许您在本地无缝发布摘要统计信息的Web应用程序 或者在网上。 虽然grape可以在一台硬件要求不高的独立机器上运行，但是 设计为在计算机群集上并行运行。葡萄有自己的缺点 映射和量化工具，使您可以轻松地用 你自己的，因为他们支持流行的数据交换格式。葡萄正在积极地 在CRG开发，并用于大量数据集的几十个项目中， 类似于illumina body map项目（hbm）和encode项目。
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