用于以编程方式与来自python的genepattern交互的库。
genepattern-python的Python项目详细描述
genepattern python库
这是一个python库,用于以编程方式使用genepattern。在幕后,这个库中的调用执行genepatternstapi。
支持的Python版本
这个库需要Python3.4+。捆绑数据子模块gp.data
也需要pandas,尽管模块的其余部分不需要。
python 2支持:在版本1.4.0中删除了对python 2的支持。Python2用户应该使用1.3.1版。
安装
建议从pip安装此库。只需执行下面的命令:
pip install genepattern-python
升级
要升级到库的最新版本,请执行以下命令:
pip install genepattern-python --upgrade
教程
关于如何使用genepattern python库的教程是available here。
“通过对等方重置连接”错误
连接到genepattern公共服务器现在需要tls 1.2+。旧版本的ssl和tls将不再工作。如果您试图连接并收到“connection reset by peer”错误,则需要更新与python安装相关联的openssl库。