flim-fret分析管道
flimfret的Python项目详细描述
flimfret
——
首先，你需要设置你的数据文件夹。
它应该是这样的：
you folder/
datadatacollection/datacolcollection/
celltype1/
1.dat
2.dat
3.dat
celltype2/
1.dat
2.dat
2.dat
3.dat
celltyp3.dat
>1.dat
>2.dat
>2.dat
>3.dat
3.dat
*.dat文件是生命周期symphotime（开发中：其他格式）的曲线输出w/拟合模型，必须是数字，然后是.dat。
若要使用（请小心），只需导航到您的文件夹（如上图所示）并在启动python解释器后运行以下命令：：
>；>；导入flimfret
>；>；print flimfret.pipeline（）
这将在每个celltype文件夹中创建一个新文件夹，其中包含规范化数据
2）每个celltype的拟合和衰减平均值的文件
3）每个celltype的残差、拟合和衰减的编译数据的文件
4）长格式的文件（适用于下游r分析）残差、拟合和衰减的编译数据每个celltype的衰减
5）长格式文件（适用于下游r分析）编译后的拟合平均数据，以及所有celltype的衰减
——
首先，你需要设置你的数据文件夹。
它应该是这样的：
you folder/
datadatacollection/datacolcollection/
celltype1/
1.dat
2.dat
3.dat
celltype2/
1.dat
2.dat
2.dat
3.dat
celltyp3.dat
>1.dat
>2.dat
>2.dat
>3.dat
3.dat
*.dat文件是生命周期symphotime（开发中：其他格式）的曲线输出w/拟合模型，必须是数字，然后是.dat。
若要使用（请小心），只需导航到您的文件夹（如上图所示）并在启动python解释器后运行以下命令：：
>；>；导入flimfret
>；>；print flimfret.pipeline（）
这将在每个celltype文件夹中创建一个新文件夹，其中包含规范化数据
2）每个celltype的拟合和衰减平均值的文件
3）每个celltype的残差、拟合和衰减的编译数据的文件
4）长格式的文件（适用于下游r分析）残差、拟合和衰减的编译数据每个celltype的衰减
5）长格式文件（适用于下游r分析）编译后的拟合平均数据，以及所有celltype的衰减
欢迎加入QQ群-->： 979659372
