斐济的最新生命线版本,易于包含在python项目中。
fijibin的Python项目详细描述
此软件将下载最新的life line版本 Fiji,生成正确的跨平台二进制文件 提供并提供一个宏子模块,使斐济自动化 来自python的琐碎信息。
视频演示
此包中当前的斐济生活线版本是2014年11月25日。
如果您在这个模块上遇到任何问题,请submit an issue或发送一个pull 对github的请求。
安装
pip install fijibin
用法
>>>importfijibin>>>fijibin.BIN'/Users/arve/.bin/Fiji.app/Contents/MacOS/ImageJ-macosx'>>>fijibin.FIJI_VERSION'20141125'
fijibin.BIN将指向Linux、Mac或Windows版本,具体取决于 在操作系统上通过 platform。
宏
importfijibin.macromacro.run(macro_string_or_list_of_strings)
开发
安装依赖项并将fijibin的开发版本链接到pip:
git clone https://github.com/arve0/fijibin
cd fijibin
pip install -r requirements.txt
运行测试
pip install tox tox
额外输出,出错时跳转到PDB
DEBUG=fijibin tox -- --pdb -s
构建api引用
pip install -r docs/requirements.txt make docs