斐济的最新生命线版本,易于包含在python项目中。

fijibin的Python项目详细描述


此软件将下载最新的life line版本 Fiji,生成正确的跨平台二进制文件 提供并提供一个宏子模块,使斐济自动化 来自python的琐碎信息。

视频演示

image0

此包中当前的斐济生活线版本是2014年11月25日

如果您在这个模块上遇到任何问题,请submit an issue或发送一个pull 对github的请求。

安装

pip install fijibin

用法

>>>importfijibin>>>fijibin.BIN'/Users/arve/.bin/Fiji.app/Contents/MacOS/ImageJ-macosx'>>>fijibin.FIJI_VERSION'20141125'

fijibin.BIN将指向Linux、Mac或Windows版本,具体取决于 在操作系统上通过 platform

importfijibin.macromacro.run(macro_string_or_list_of_strings)

refetch二进制

>>>fromfijibin.fetchimportfetch>>>fetch()

请参阅API reference中的更多信息。

开发

安装依赖项并将fijibin的开发版本链接到pip:

git clone https://github.com/arve0/fijibin
cd fijibin
pip install -r requirements.txt

运行测试

pip install tox
tox

额外输出,出错时跳转到PDB

DEBUG=fijibin tox -- --pdb -s

构建api引用

pip install -r docs/requirements.txt
make docs

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