使用fasta文件的工具。

fastatools的Python项目详细描述


https://img.shields.io/pypi/v/fastatools.svg

使用fasta文件的工具。

Fastatools包装是由美国食品公司开发的 以及药品管理局,食品安全和应用营养中心。

功能

  • 打印序列的长度。
  • 确定两个fasta文件是否相等。
  • 修复不一致的行长度和不一致的小写。
  • 生成fasta文件的反向补码。
  • 从由引物分隔的fasta文件中提取一个片段。
  • 从fasta文件中提取一系列位置。

引用fastatools

要引用fastatools,请参考fastatools github存储库:

https://github.com/CFSAN-Biostatistics/fastatools

许可证

请参阅FastAtools发行版中包含的许可证文件。

历史记录

1.2.0(2018-12-10)

  • 首次公开发布,带有文档和自动化测试。

1.1.0(2018-10-25)

  • add range命令从fasta文件中提取位置范围。
  • 添加equiv命令以检查等效的fasta文件。
  • 添加rewrite命令以修复行长度和大小写不一致。

1.0.0(2018-09-21)

  • add length命令打印fasta文件中所有序列的长度。

0.1.0(2017-11-30)

  • 项目开始。

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