使用fasta文件的工具。
fastatools的Python项目详细描述
使用fasta文件的工具。
Fastatools包装是由美国食品公司开发的 以及药品管理局,食品安全和应用营养中心。
- 免费软件
- 文档:https://fastatools.readthedocs.io
- 源代码:https://github.com/CFSAN-Biostatistics/fastatools
- PYPI分布:https://pypi.python.org/pypi/fastatools
功能
- 打印序列的长度。
- 确定两个fasta文件是否相等。
- 修复不一致的行长度和不一致的小写。
- 生成fasta文件的反向补码。
- 从由引物分隔的fasta文件中提取一个片段。
- 从fasta文件中提取一系列位置。
许可证
请参阅FastAtools发行版中包含的许可证文件。
历史记录
1.2.0(2018-12-10)
- 首次公开发布,带有文档和自动化测试。
1.1.0(2018-10-25)
- add range命令从fasta文件中提取位置范围。
- 添加equiv命令以检查等效的fasta文件。
- 添加rewrite命令以修复行长度和大小写不一致。
1.0.0(2018-09-21)
- add length命令打印fasta文件中所有序列的长度。
0.1.0(2017-11-30)
- 项目开始。