elkoa 1.3.0

说明

ELK光学分析仪（ELKOA）帮助分析光学输出数据 The Elk Code。

功能

麋鹿光学分析仪…

• 带有一个gui和一个python cli
• 支持ELK任务121、187、320和330
• 自动识别可用的任务/（张量）字段
• 易于扩展

用户可以…

• 可视化麋鹿光学系统的实部和虚部输出数据 多种方式
• 导入其他数据文件，例如实验测量ctrl+o
• 通过Universal Response Relations转换响应函数，例如εσctrl+c
• 将介电张量转换为（超）普通折射率 对于任意波矢量，按ctrl+c
• 通过对话框ctrl+t选择要单独绘制的张量元素
• 对所有绘图使用全局张量元素设置ctrl+g
• 批量加载参数的可视化分析 不同的参数设置ctrl+b
• 以不同格式写出显示的数据ctrl+w

即将到来：

• 索引椭球体的三维绘图
• 一组不同q点的批量转换
• 样品/几何相关（即薄膜）响应转换 功能

要求

• Python 3.x
• numpy
• matplotlib
• PyQt5
• pbr

您应该使用Linux发行版提供的软件包。打开 例如，您可以通过 运行

apt install python3-numpy python3-matplotlib python3-pyqt5 python3-pbr

或者，您可以获取每个包的最新pypi版本 通过pip自动安装（见下文）。

出于测试目的，您还需要以下软件包：* pytest*pytest qt*pytest mpl*鼻子

安装

安装elkoa的最简单方法是通过pip，直接从pypi安装。

pip install elkoa

或者，如果您想要最新的git版本，

git clone https://github.com/PandaScience/ElkOpticsAnalyzer.git
cd ElkOpticsAnalyzer
pip install .

这也将安装所有必需但不存在的python包 自动从PYPI。

如果您只想为当前用户安装elkoa，请添加标志 --user。如果您想处理所需的python包 您自己（即使用Linux发行版提供的软件） 添加--no-deps。如果要运行开发人员安装（否 复制文件，而不是直接使用git repo文件），添加-e。

无论如何，在安装之后，您可以从 使用elkoa或 ElkOpticsAnalyzer。

另一种安装方法是如上文所述克隆repo，而不是 通过pip安装，放置类似于

exportPATH=$PATH:/path/to/ElkOpticsAnalyzer/elkoa/gui
exportPYTHONPATH=$PYTHONPATH:/path/to/ElkOpticsAnalyzer/

给你的.bashrc或.bash_profile。然后你就可以开始 带ElkOpticsAnalyzer.py的图形用户界面。

测试

使用pytest库完成测试。确保已安装 所有附加要求。

1. 下载并提取样本数据
   • 待办事项
2. 运行（–mpl标志是必需的！）

pytesttest_figures.py--mpl

python cli

在包含文件的elk输出目录中

elk.in INFO.OUT EPSILON_11.OUT EPSILON_12.OUT EPSILON_13.OUT EPSILON_21.OUT
EPSILON_22.OUT EPSILON_23.OUT EPSILON_31.OUT EPSILON_32.OUT EPSILON_33.OUT

您可以在python3解释器中运行：

fromelkoa.utilsimportelk,io,convert# parse Elk input fileelk_input=elk.ElkInput()# read specific input parametereta=elk.readElkInputParameter("swidth")# read tensorial Elk optics output (ij = dummy for 11, 12, etc.)freqs,epsilon=io.readTenElk("EPSILON_TDDFT_ij.OUT")# create converter instanceq=[0,0,0]converter=convert.Converter(q,freqs,eta,opticalLimit=True)# convert dielectric tensor to optical conductivitysigma=converter.epsilonToSigma(epsilon)# write out converted tensorio.writeTensor("sigma_ij_test.dat",freqs,sigma,threeColumn=True)# write out 11-element of converted tensorio.writeScalar("sigma_11-scalar.dat",freqs,sigma[0,0,:],threeColumn=True)

其他

• 自动将文件名转换为文本标签
  • 要使用此功能，文件名必须遵循以下模式 root+_sub+.ext，它将显示为rootsub。
  • 如果root包含不区分大小写的子字符串，如eps， epsilon、sig、sigma等，对应的希腊字母为 使用，即eps ex datεex.
• 附加数据图
  • 数字限制为6，但作为回报，我们使用一致的 连续添加更多绘图后着色。

使用示例gui