Django应用程序解析/加载表型本体(OnTree、HPO、World等)
django-phenotype-ontologies的Python项目详细描述
Django应用程序解析/加载表型本体(OnTree、HPO、Mondo等)
快速启动
安装django表型本体:
pip install django-phenotype-ontologies
将其添加到已安装的应用程序中
INSTALLED_APPS=(...'phenotype_ontologies',...)
添加django表型本体的url模式:
fromphenotype_ontologiesimporturlsasphenotype_ontologies_urlsurlpatterns=[...url(r'^',include(phenotype_ontologies_urls,namespace='phenotype_ontologies')),...]
功能
- 同步来自mondo、hpo和ncit(oncotree)的obo
- 与模型交互的rest api
- 将用GelnEngJango 合并到现有的图形化设置中的图形节点
运行测试
代码真的有用吗?
source <YOURVIRTUALENV>/bin/activate (myenv) $ pip install tox (myenv) $ tox
历史记录
0.1.0(2018-04-10)
- 表型本体论模型
- rest api
- graphql节点
- mondo、hpo、ncit的purl同步方法