深埋单细胞rna序列聚类

desc的Python项目详细描述


DESC是一种无监督的用于SCRNA序列数据聚类的深度学习算法。该算法通过迭代学习特定于簇的基因表达表示和基于深度神经网络的簇分配,从原始的scrna序列数据空间构造到低维特征空间的非线性映射函数。这个迭代过程将每个细胞移动到其最近的集群,平衡集群之间的生物和技术差异,并减少批量效应的影响。DESC还通过为每个单元分配特定于簇的概率来实现软聚类,这有助于高置信度聚类单元的识别和结果的解释。

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