带缺失的卷积神经网络预测蛋白质接触
deepcon的Python项目详细描述
deepcon：使用带缺失的扩张卷积神经网络预测蛋白质接触
联系人：
电子邮件：adhikarib@umsl.edu
主页：https://badriadhikari.github.io/
纸张：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/590455v1
使用协方差特征作为输入的deepcon
使用deepcov数据集中的3456个蛋白质，以协方差特征（441个通道）作为输入进行训练和验证。
安装说明：
您需要一个与Keras兼容的深入学习后端：
pip3 install -U tensorflow
pip3 install pyyaml
安装DeepCon协方差包
pip3 install deepcon
用户说明：
在python内部：
import deepcon
预测
python ../deepcon-covariance.py --aln ./16pkA0.aln --rr ./16pkA0.rr
评估
./coneva-lite.pl -pdb ./16pkA.pdb -rr ./16pkA0.rr
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