DICOM预处理接口。

dcmpi的Python项目详细描述


dcmpi-dicom预处理接口: 探索/提取DICOM数据。

该软件实现了从dicom中自动提取信息的工具。 包含MRI采集的文件。它专门针对输出 西门子的扫描仪,虽然它应该很容易适应其他的 最后甚至是不同的收购方式。

它具有一个图形用户界面来管理最常用的导出选项。 这也由同一软件的cli镜像。

此外,还提供了其他一些命令行工具,它们提供了 更精细地控制单个任务。

可用的任务是:

  • dicom拷贝/移动和按采集排序 (包括收购和系列的json摘要)
  • dicom元数据提取及json存储实验
  • 采集协议信息的提取
  • 从dicom中提取对人类友好的信息,存储为json
  • 图像数据的提取及nifti格式的转换 (这是通过软件支持的 dcm2nii, 部分支持其他项目,如 isis
  • 从dicom信息创建html报表 (通过wkhtmltopdf支持PDF转换)
  • 将DICOM文件备份为压缩存档文件
  • 监视文件夹以检测新DICOM文件的外观

后续的数据分析可能最好使用 PyMRT,它本机理解 DCMPI的输出。

注释

这项工作基于dicom文件的逆向工程,因此应该 不能作为可靠的信息来源。 某些功能仅部分受支持。 如果您想推荐其他功能,请联系我们。

警告

这是一个研究工具,按原样提供。 请勿not根据此软件处理的信息进行任何诊断!

安装

建议安装软件的方法是通过 PyPI

$ pip install dcmpi

或者,您可以从 Bitbucket

$ mkdir dcmpi
$ cd dcmpi
$ git clone git@bitbucket.org:norok2/dcmpi.git
$ python setup.py install

有关详细信息,请参见INSTALL.rst

许可证

本作品通过 GPLv3+ 将本软件用于科学目的,并最终出版 应通过引用即将发表的论文予以确认。

致谢

这个软件是我在 Max Planck Institute for Human Cognitive and Brain SciencesUniversity of Leipzig

有关作者的完整列表,请参见AUTHORS.rst

影响这项工作的人在THANKS.rst中得到承认。

这项工作部分由欧盟资助。 通过第七个框架计划玛丽·居里行动 通过“超高场磁共振成像:HIMR” 初始培训网络(FP7-People-2012-ITN-316716)。

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

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