用于神经/医学成像的datalad扩展包
datalad_neuroimaging的Python项目详细描述
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Travis tests statuscodecov.ioDocumentationhttps://www.singularity-hub.org/static/img/hosted-singularity–hub-%23e32929.svgLicense: MITGitHub releasePyPI version fury.ioAverage time to resolve an issuePercentage of issues still open
这个扩展增强了datalad(http://datalad.org)用于处理 神经影像数据和工作流程。请参阅extension documentation以获取 其他命令和功能的说明。
有关如何使用或贡献datalad的一般信息(以及 分机),请参见DataLad website或 这个main GitHub project page。
安装
安装此软件包之前,请确保install a recent version of git-annex。之后, 从安装最新版本的datalad-neuroimagingPyPi。它是 建议使用专用 virtualenv:
# create and enter a new virtual environment (optional) virtualenv --system-site-packages --python=python3 ~/env/dataladni . ~/env/dataladni/bin/activate # install from PyPi pip install datalad_neuroimaging
还有一个Singularity container 可用。可以通过运行以下命令获得最新版本:
singularity pull shub://datalad/datalad-neuroimaging
支架
本项目的文件如下: http://docs.datalad.org/projects/neuroimaging
此软件的所有错误、问题和增强请求可以是 在此提交:https://github.com/datalad/datalad-neuroimaging/issues
如果你有问题或者想问一个关于如何使用的问题 datalad,请用 datalad标记。neurostars.org是一个类似stackoverflow的平台 但致力于神经信息学。
所有先前的datalad问题都可以在这里找到: http://neurostars.org/tags/datalad/
致谢
datalad的开发得到了美德在 计算神经科学项目 将目录、仓库和部署后勤集成到联邦数据中 “发行”(Halchenko/Hanke),由美国国家科学基金会共同资助 基金会(NSF 1429999)和德国联邦教育部 以及研究(BMBF 01GQ1411)。额外的支持由 德国联邦萨克森州和欧洲地区 发展基金(ERDF),项目:行为脑科学中心, 成像平台。这项工作由重新修订进一步促进。 项目(NIH 1P41EB019936-01A1)。