分集阵列技术中snp数据的质量控制
dartqc的Python项目详细描述
##dartqc
质量控制管道
命令行管道，以便于对来自分集阵列技术（dart）的snp数据进行质量控制。此版本是对原始脚本的重新编写，目的是在JCU的HPC上更方便用户和执行。
这假设您在本地unix系统或jcu的hpc（zodiac）上使用bash shell。[安装dartqc]（https://github.com/esteing/dartqc/blob/master/readme/install.md）
2.[任务：准备]（https://github.com/esteing/dartqc/blob/master/readme/task.prepare.md）
3.[任务：进程]（https://github.com/esteing/dartqc/blob/master/readme/task.process.md）
4.[任务：筛选]（https://github.com/esteing/dartqc/blob/master/readme/task.filter.md）
5.[Dartqc on Zodiac]（
\filter）具有自己的特定参数：
```
dartqc--help
dartqc filter--help
````
像这样：
**`dartqc`**`--项目示例--输出路径.``**`prepar ``**`--文件示例--数据.csv `
//35 35
<
<
csv
<
<
dartqc准备工作流程示例--文件示例--准备示例--文件示例.csv；excel
dartqc准备--文件example.xlsx--sheet double_row_snps
source deactivate
``````
filter-c calls.csv--call_scheme calls_scheme.json-r raw.csv--raw_scheme raw_scheme.json--read_threshold 7
source deactivate
````
<；p align=“center”>；
<；img src=“https://github.com/esteing/dartqc/blob/master/workflow.png”height=“768”width=“768”>；
<；/p>；
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质量控制管道
命令行管道，以便于对来自分集阵列技术（dart）的snp数据进行质量控制。此版本是对原始脚本的重新编写，目的是在JCU的HPC上更方便用户和执行。
这假设您在本地unix系统或jcu的hpc（zodiac）上使用bash shell。[安装dartqc]（https://github.com/esteing/dartqc/blob/master/readme/install.md）
2.[任务：准备]（https://github.com/esteing/dartqc/blob/master/readme/task.prepare.md）
3.[任务：进程]（https://github.com/esteing/dartqc/blob/master/readme/task.process.md）
4.[任务：筛选]（https://github.com/esteing/dartqc/blob/master/readme/task.filter.md）
5.[Dartqc on Zodiac]（
\filter）具有自己的特定参数：
```
dartqc--help
dartqc filter--help
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像这样：
**`dartqc`**`--项目示例--输出路径.``**`prepar ``**`--文件示例--数据.csv `
//35 35
<
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csv
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dartqc准备工作流程示例--文件示例--准备示例--文件示例.csv；excel
dartqc准备--文件example.xlsx--sheet double_row_snps
source deactivate
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source deactivate
````
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<；img src=“https://github.com/esteing/dartqc/blob/master/workflow.png”height=“768”width=“768”>；
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