包装PYHGNC以在不同基因标识符之间执行映射的包

compath-hgnc的Python项目详细描述


该软件包支持跨不同蛋白质/基因标识符的映射。

引文

格雷卡,耶茨B,海豹RL,莱特MW,布鲁福德EA。genenames.org:2015年的HGNC资源。2015年核酸研究 1月43日(数据库问题):D1079-85。doi:10.1093/nar/gku1071。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25361968

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compath_hgnc可以通过PyPI轻松安装 在您喜爱的终端中执行以下代码:

$ python3 -m pip install compath_hgnc

或者来自GitHub上的最新代码,使用:

$ python3 -m pip install git+https://github.com/compath/compath_hgnc.git@master

设置

hgnc可以从python repl或自动安装的命令行下载和填充 公用事业。

Python复制

>>>importcompath_hgnc>>>compath_hgnc_manager=compath_hgnc.Manager()>>>compath_hgnc_manager.populate()

命令行实用程序

compath_hgnc populate

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